MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Simkania negevensis Z chromosome gsn.131

Total Repeats: 51831

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015713	A	8	8	1	8	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015713	A	6	6	23	28	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015713	ATT	2	6	42	47	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015713	ATCT	2	8	146	153	25 %	50 %	0 %	25 %	338731897
5	NC_015713	TTA	2	6	186	191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731897
6	NC_015713	TA	3	6	200	205	50 %	50 %	0 %	0 %	338731897
7	NC_015713	AGA	2	6	235	240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731897
8	NC_015713	GTTC	2	8	262	269	0 %	50 %	25 %	25 %	338731897
9	NC_015713	ACT	3	9	309	317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
10	NC_015713	A	8	8	322	329	100 %	0 %	0 %	0 %	338731897
11	NC_015713	AAT	2	6	343	348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
12	NC_015713	ATTA	2	8	364	371	50 %	50 %	0 %	0 %	338731897
13	NC_015713	CAATAT	2	12	385	396	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	338731897
14	NC_015713	AC	3	6	398	403	50 %	0 %	0 %	50 %	338731897
15	NC_015713	ATC	2	6	419	424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
16	NC_015713	ATA	2	6	425	430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
17	NC_015713	CTA	2	6	443	448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
18	NC_015713	TGC	2	6	472	477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731897
19	NC_015713	TGA	2	6	555	560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731897
20	NC_015713	TAC	2	6	580	585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
21	NC_015713	AAT	2	6	607	612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
22	NC_015713	TAT	2	6	618	623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731897
23	NC_015713	AGA	2	6	659	664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731897
24	NC_015713	A	6	6	690	695	100 %	0 %	0 %	0 %	338731897
25	NC_015713	CTT	2	6	701	706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
26	NC_015713	CTT	3	9	724	732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
27	NC_015713	AAT	2	6	736	741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
28	NC_015713	TTC	2	6	756	761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
29	NC_015713	TAA	2	6	762	767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
30	NC_015713	T	6	6	808	813	0 %	100 %	0 %	0 %	338731897
31	NC_015713	TC	3	6	827	832	0 %	50 %	0 %	50 %	338731897
32	NC_015713	TAT	2	6	846	851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731897
33	NC_015713	ATG	2	6	896	901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731897
34	NC_015713	TTAT	2	8	907	914	25 %	75 %	0 %	0 %	338731897
35	NC_015713	TCT	2	6	943	948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731897
36	NC_015713	TC	3	6	1032	1037	0 %	50 %	0 %	50 %	338731897
37	NC_015713	GTT	2	6	1062	1067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731897
38	NC_015713	T	7	7	1069	1075	0 %	100 %	0 %	0 %	338731897
39	NC_015713	AAAC	2	8	1127	1134	75 %	0 %	0 %	25 %	338731897
40	NC_015713	CAT	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
41	NC_015713	AC	3	6	1182	1187	50 %	0 %	0 %	50 %	338731897
42	NC_015713	TTTC	2	8	1263	1270	0 %	75 %	0 %	25 %	338731897
43	NC_015713	AAT	2	6	1327	1332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731897
44	NC_015713	ACT	2	6	1337	1342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731897
45	NC_015713	A	6	6	1369	1374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015713	CAA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015713	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015713	AAT	2	6	1485	1490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015713	CTTT	2	8	1551	1558	0 %	75 %	0 %	25 %	338731898
50	NC_015713	AGCA	2	8	1559	1566	50 %	0 %	25 %	25 %	338731898
51	NC_015713	A	8	8	1590	1597	100 %	0 %	0 %	0 %	338731898
52	NC_015713	CTT	2	6	1690	1695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731898
53	NC_015713	TTTGA	2	10	1797	1806	20 %	60 %	20 %	0 %	338731898
54	NC_015713	TTTC	2	8	1810	1817	0 %	75 %	0 %	25 %	338731898
55	NC_015713	GA	4	8	1844	1851	50 %	0 %	50 %	0 %	338731898
56	NC_015713	T	6	6	1871	1876	0 %	100 %	0 %	0 %	338731898
57	NC_015713	GCT	2	6	1892	1897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731898
58	NC_015713	TAT	2	6	1926	1931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731898
59	NC_015713	GCT	2	6	1980	1985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731898
60	NC_015713	AG	3	6	2016	2021	50 %	0 %	50 %	0 %	338731898
61	NC_015713	A	7	7	2048	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	338731898
62	NC_015713	AATGA	2	10	2094	2103	60 %	20 %	20 %	0 %	338731898
63	NC_015713	GAA	2	6	2160	2165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731898
64	NC_015713	AGA	2	6	2213	2218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731898
65	NC_015713	TTA	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015713	AAT	2	6	2362	2367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015713	AT	3	6	2394	2399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015713	TTA	2	6	2430	2435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015713	A	6	6	2582	2587	100 %	0 %	0 %	0 %	338731899
70	NC_015713	TCA	2	6	2642	2647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731899
71	NC_015713	A	8	8	2652	2659	100 %	0 %	0 %	0 %	338731899
72	NC_015713	AAT	2	6	2696	2701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731899
73	NC_015713	GCT	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731899
74	NC_015713	A	9	9	2857	2865	100 %	0 %	0 %	0 %	338731899
75	NC_015713	AT	3	6	2871	2876	50 %	50 %	0 %	0 %	338731899
76	NC_015713	T	6	6	2876	2881	0 %	100 %	0 %	0 %	338731899
77	NC_015713	TTTTCT	2	12	2912	2923	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	338731899
78	NC_015713	GAA	2	6	2924	2929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
79	NC_015713	T	7	7	2967	2973	0 %	100 %	0 %	0 %	338731899
80	NC_015713	AAG	2	6	2985	2990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
81	NC_015713	AGC	3	9	3010	3018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338731899
82	NC_015713	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
83	NC_015713	ACA	2	6	3195	3200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338731899
84	NC_015713	T	7	7	3208	3214	0 %	100 %	0 %	0 %	338731899
85	NC_015713	TGA	2	6	3238	3243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
86	NC_015713	ATA	2	6	3291	3296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731899
87	NC_015713	CCA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338731899
88	NC_015713	ATG	2	6	3467	3472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
89	NC_015713	TCA	2	6	3509	3514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731899
90	NC_015713	TCT	3	9	3587	3595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731899
91	NC_015713	TA	3	6	3633	3638	50 %	50 %	0 %	0 %	338731899
92	NC_015713	AGAA	2	8	3715	3722	75 %	0 %	25 %	0 %	338731899
93	NC_015713	CT	3	6	3802	3807	0 %	50 %	0 %	50 %	338731899
94	NC_015713	TTAA	2	8	3866	3873	50 %	50 %	0 %	0 %	338731899
95	NC_015713	T	6	6	3898	3903	0 %	100 %	0 %	0 %	338731899
96	NC_015713	ATG	2	6	3929	3934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
97	NC_015713	AAG	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731899
98	NC_015713	CT	3	6	4003	4008	0 %	50 %	0 %	50 %	338731899
99	NC_015713	CTC	2	6	4032	4037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731899
100	NC_015713	A	6	6	4119	4124	100 %	0 %	0 %	0 %	338731899
101	NC_015713	CTG	2	6	4275	4280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731899
102	NC_015713	TGT	2	6	4477	4482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731899
103	NC_015713	A	6	6	4491	4496	100 %	0 %	0 %	0 %	338731899
104	NC_015713	ATA	2	6	4650	4655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731899
105	NC_015713	GAT	2	6	4706	4711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
106	NC_015713	TC	3	6	4719	4724	0 %	50 %	0 %	50 %	338731899
107	NC_015713	AAAC	2	8	4736	4743	75 %	0 %	0 %	25 %	338731899
108	NC_015713	A	6	6	4760	4765	100 %	0 %	0 %	0 %	338731899
109	NC_015713	GAT	2	6	4793	4798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731899
110	NC_015713	CT	3	6	4822	4827	0 %	50 %	0 %	50 %	338731899
111	NC_015713	CTG	2	6	4848	4853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731899
112	NC_015713	ATT	2	6	4883	4888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731899
113	NC_015713	ATGAA	2	10	4982	4991	60 %	20 %	20 %	0 %	338731900
114	NC_015713	A	6	6	4990	4995	100 %	0 %	0 %	0 %	338731900
115	NC_015713	CAT	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731900
116	NC_015713	TGA	2	6	5112	5117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731900
117	NC_015713	AG	3	6	5221	5226	50 %	0 %	50 %	0 %	338731900
118	NC_015713	GACC	2	8	5235	5242	25 %	0 %	25 %	50 %	338731900
119	NC_015713	AGA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
120	NC_015713	TAT	2	6	5359	5364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731900
121	NC_015713	ATT	2	6	5438	5443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731900
122	NC_015713	GTAT	2	8	5527	5534	25 %	50 %	25 %	0 %	338731900
123	NC_015713	CAGT	2	8	5541	5548	25 %	25 %	25 %	25 %	338731900
124	NC_015713	TCA	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731900
125	NC_015713	AGGA	2	8	5627	5634	50 %	0 %	50 %	0 %	338731900
126	NC_015713	T	6	6	5639	5644	0 %	100 %	0 %	0 %	338731900
127	NC_015713	GCC	2	6	5660	5665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338731900
128	NC_015713	GGA	2	6	5683	5688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731900
129	NC_015713	ATG	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731900
130	NC_015713	CAAG	2	8	5842	5849	50 %	0 %	25 %	25 %	338731900
131	NC_015713	TC	3	6	5899	5904	0 %	50 %	0 %	50 %	338731900
132	NC_015713	TTAA	2	8	6058	6065	50 %	50 %	0 %	0 %	338731900
133	NC_015713	GCT	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731900
134	NC_015713	CAT	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731900
135	NC_015713	AACCC	2	10	6119	6128	40 %	0 %	0 %	60 %	338731900
136	NC_015713	GAA	2	6	6184	6189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
137	NC_015713	AGA	2	6	6252	6257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731900
138	NC_015713	CCT	2	6	6259	6264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731900
139	NC_015713	AG	3	6	6277	6282	50 %	0 %	50 %	0 %	338731900
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275	NC_015713	TCT	2	6	11929	11934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_015713	CTC	2	6	12104	12109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
279	NC_015713	CT	3	6	12192	12197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
280	NC_015713	TGA	2	6	12266	12271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_015713	TTG	2	6	18577	18582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731916
413	NC_015713	GCT	2	6	18615	18620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731916
414	NC_015713	A	6	6	18624	18629	100 %	0 %	0 %	0 %	338731916
415	NC_015713	GA	3	6	18652	18657	50 %	0 %	50 %	0 %	338731916
416	NC_015713	AG	3	6	18752	18757	50 %	0 %	50 %	0 %	338731916
417	NC_015713	AGA	2	6	18759	18764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731916
418	NC_015713	CGC	2	6	18809	18814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338731916
419	NC_015713	TTG	2	6	18868	18873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338731916
420	NC_015713	TAT	2	6	18923	18928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731916
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425	NC_015713	CTT	2	6	19084	19089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731916
426	NC_015713	TGA	2	6	19160	19165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731916
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434	NC_015713	GCTCG	2	10	19656	19665	0 %	20 %	40 %	40 %	338731916
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441	NC_015713	A	6	6	19997	20002	100 %	0 %	0 %	0 %	338731916
442	NC_015713	A	6	6	20035	20040	100 %	0 %	0 %	0 %	338731916
443	NC_015713	CA	3	6	20099	20104	50 %	0 %	0 %	50 %	338731916
444	NC_015713	AAT	2	6	20144	20149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731916
445	NC_015713	T	6	6	20218	20223	0 %	100 %	0 %	0 %	338731916
446	NC_015713	TGG	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731916
447	NC_015713	ATC	2	6	20429	20434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731916
448	NC_015713	TAA	2	6	20462	20467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338731916
449	NC_015713	TCA	2	6	20476	20481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731916
450	NC_015713	TGA	2	6	20501	20506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731916
451	NC_015713	GAA	2	6	20724	20729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731916
452	NC_015713	TCA	2	6	20783	20788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338731916
453	NC_015713	GGT	2	6	20823	20828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731916
454	NC_015713	TTA	2	6	20845	20850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338731916
455	NC_015713	TGA	2	6	20957	20962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731916
456	NC_015713	GA	3	6	21056	21061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
457	NC_015713	T	6	6	21095	21100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_015713	CTT	2	6	21105	21110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
459	NC_015713	A	6	6	21138	21143	100 %	0 %	0 %	0 %	338731917
460	NC_015713	CCT	2	6	21282	21287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338731917
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462	NC_015713	T	6	6	21422	21427	0 %	100 %	0 %	0 %	338731918
463	NC_015713	TAAA	2	8	21455	21462	75 %	25 %	0 %	0 %	338731918
464	NC_015713	GT	4	8	21751	21758	0 %	50 %	50 %	0 %	338731918
465	NC_015713	TGG	2	6	21763	21768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731918
466	NC_015713	T	6	6	21829	21834	0 %	100 %	0 %	0 %	338731918
467	NC_015713	AGG	2	6	21852	21857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731918
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469	NC_015713	GT	3	6	21913	21918	0 %	50 %	50 %	0 %	338731918
470	NC_015713	TGGA	2	8	21983	21990	25 %	25 %	50 %	0 %	338731918
471	NC_015713	AG	3	6	22091	22096	50 %	0 %	50 %	0 %	338731918
472	NC_015713	GGT	2	6	22128	22133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731918
473	NC_015713	CTT	2	6	22144	22149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
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476	NC_015713	CTT	2	6	22219	22224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
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479	NC_015713	AG	3	6	22403	22408	50 %	0 %	50 %	0 %	338731918
480	NC_015713	TTTGA	2	10	22424	22433	20 %	60 %	20 %	0 %	338731918
481	NC_015713	TGA	2	6	22447	22452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731918
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483	NC_015713	GAA	3	9	22492	22500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338731918
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486	NC_015713	GAG	2	6	22562	22567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338731918
487	NC_015713	TGA	3	9	22587	22595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338731918
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489	NC_015713	TCT	2	6	22735	22740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
490	NC_015713	GTC	2	6	22745	22750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731918
491	NC_015713	A	7	7	22772	22778	100 %	0 %	0 %	0 %	338731918
492	NC_015713	GGC	2	6	22817	22822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338731918
493	NC_015713	T	6	6	22851	22856	0 %	100 %	0 %	0 %	338731918
494	NC_015713	GCT	2	6	22863	22868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338731918
495	NC_015713	CTT	2	6	22912	22917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338731918
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497	NC_015713	T	8	8	23006	23013	0 %	100 %	0 %	0 %	338731918
498	NC_015713	A	8	8	23026	23033	100 %	0 %	0 %	0 %	338731918
499	NC_015713	G	7	7	23077	23083	0 %	0 %	100 %	0 %	338731918
500	NC_015713	GTG	2	6	23172	23177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338731918

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